Через четыре дня, 24 октября, директор ГИИ Наталия Сиповская прислала Миронову ответ (документ также​ имеется в распоряжении РБК). К ее письму приложено заключение на имущественные претензии РПЦ за авторством Елены Щеболевой, ведущего научного сотрудника ГИИ, кандидата искусствоведения. Она является экспертом по государственной историко-культурной экспертизе, аттестованным в Минкультуры.

Эксперт приводит обширную историческую справку касательно здания палат думного дьяка Аверкия Кириллова и соседнего храма. Она подтверждает слова Миронова: здание не было построено для осуществления религиозной деятельности, там никогда не совершались богослужения, а церковный и усадебный участки развивались самостоятельно и не связаны общей историей.

«Архивный и биографический материал, касающийся архитектурного ансамбля на Берсеневской набережной, со всей неопровержимостью доказывает, что попытки связать историю палат Аверкия Кириллова с Никольским храмом не имеют под собой каких-либо оснований», — делает вывод Щеболева. По ее словам, церковь не может претендовать на здание Института культурного наследия по закону о церковной реституции.

Директор Института культурного наследия Арсений Миронов сказал РБК, что экспертиза ГИИ — «это не чье-то досужее мнение, это заключение ученых, основанное на исторических документах».

«Мне кажется, при обсуждении вопроса о передаче здания нужно руководствоваться именно им, а не неким «визуальным впечатлением», иначе мы дойдем в конце концов до абсурдного вывода, что придется отдать РПЦ Большой Кремлевский дворец, потому что он составляет единый комплекс с соборами Московского Кремля», — иронизирует собеседник.

Инициатива снизу

В РПЦ на запрос РБК по поводу претензий на здание палат не ответили. 17 октября глава юридической службы Московской патриархии игуменья Ксения (Чернега) заявила «РИА Новости», что вопрос о передаче в собственность РПЦ здания на Берсеневской набережной является инициативой местной религиозной общины и этот вопрос не получил одобрения патриарха Кирилла.

«Такого документа [письменного согласия патриарха Кирилла] в пакете нет. Это означает, что вопрос о целесообразности получения в собственность религиозной общины спорного здания палат, занимаемого институтом, не решен священноначалием Русской православной церкви», — подчеркнула игуменья.

По ее словам, от передачи объекта «ввиду статуса института», «возможно, следует воздержаться», хотя правовые основания для его оформления в собственность Русской православной церкви есть, заключает Чернега.

Имущественные споры

В официальном ответе Минкультуры на запрос РБК по поводу конфликта с РПЦ говорится, что передачей имущества религиозного назначения занимается Росимущество. А передача объектов религиозного назначения возможна только при представлении равноценной замены учреждению культуры.

В письме ведомства РБК говорится, что для уточнения религиозного назначения объектов, на которые претендует церковь, Минкультуры опирается на архивные данные.

«Минкультуры России сможет сформировать официальную позицию по вопросу передачи РПЦ палат Аверкия Кириллова при поступлении соответствующего запроса Росимущества и пакета документов, обосновывающих заявление РПЦ», — заключают в ведомстве.

В Минкультуры ссылаются на ст.9 федерального закона №327, согласно которой подобные споры может решить создание комиссии с участием представителей органов госвласти, местного самоуправления, общественников, руководства религиозных организаций, специалистов в области религиоведения и так далее.

Источник РБК в ведомстве сказал, что действия по разработке аргументации против передачи РПЦ здания Института культурного наследия согласованы с замминистра культуры Владимиром Аристарховым, который курирует данный институт.

Церковная реституция в России активизировалась после принятия в 2010 году федерального закона №327 («О передаче религиозным организациям имущества»). Закон ввел заявительный порядок передачи имущества церкви и отменил необходимость согласований с Минкультуры. Кроме того, закон расширил понятие термина «имущество религиозного назначения». Объекты передаются церкви либо в собственность, либо в безвозмездное пользование религиозной организации. Новый закон был неоднозначно воспринят музейным сообществом.

Согласно анализу РБК документов на сайтах территориальных органов Росимущества, за последние четыре года православная церковь получила свыше 270 объектов имущества в 45 регионах (выгрузка производилась до 27 января 2016 года).​​