Una gestione a dir poco allegra del patrimonio della Chiesa carinziana, fatta di immobili, scuole, ostelli e beni forestali. È stato chiamato il "Sistema Schwarz", dal nome del vescovo di Klagenfurt, capoluogo della Carinzia, su cui da tempo gravavano sospetti per come disponeva a proprio piacimento dei beni della chiesa, già segnalati alla nunziatura di Vienna e anche a Roma. Come riporta La Stampa, dopo aver lasciato l'incarico per andare a ricoprire quello di Vescovo della Bassa Austria, è stato creato un gruppo di lavoro per passare al setaccio i conti della gestione fatta da Alois Schwarz

Una lievitazione di spese ingiustificate per svariati milioni. Tra queste, la costruzione di una piscina con sauna annessa, costata oltre un milione. Ma l'aspetto più delicato emerso dall'indagine ha riguardato la relazione intima che si era instaurata tra il presule e una sua collaboratrice, Andrea Erzinger, da lui nominata direttrice di un centro di formazione con un compenso annuo di 91mila euro. Il monsignore aveva praticamente perso al testa per le, lasciandole fare ciò che voleva.

Pur non essendo mai menzionato un rapporto tra due amanti direttamente, nelle conclusioni delle indagini si parla delle limitazioni a cui si sarebbe sottoposto il presule "in relazione all'obbligo del celibato previsto per i sacerdoti. E si legge: "Schwarz a causa della sua relazione, era condizionato dall'arbitrio e dagli umori di questa sua confidente".