障害者の雇用数を中央省庁が水増ししていた問題で、政府は２８日、国の３３行政機関を対象とした昨年６月１日時点の再調査結果を公表した。２７機関で計３４６０人の障害者数の不適切な算入があり、平均雇用率は従来調査から１・１９％に半減した。２７機関で当時の法定雇用率２・３％に届いていなかった。障害者雇用の旗振り役となる国の約８割の機関で、水増しが広がっていた深刻な事態となった。

菅義偉官房長官は２８日午前の会見で「障害のある方の雇用や活躍の場の拡大を民間に率先して進めていく立場としてあってはならないことと重く受け止めており、深くおわび申し上げる」と謝罪した。

再調査結果は、この日午前にあった政府の関係閣僚会議で示された。菅官房長官は、弁護士らによる経緯や原因の検証チームを設置するとともに、水増しが相次いで発覚している地方自治体の全国調査の実施を表明。１０月中に再発防止策をとりまとめるとした。加藤勝信厚生労働相はこの日の閣議後会見で、原因について「故意か誤解によるものかは今の段階では把握できていない」と話した。

再調査の結果、最も水増しが多かったのは、国税庁で１０２２・５人。雇用率は２・４７％から０・６７％に下がった。国土交通省の６０３・５人、法務省の５３９・５人が続いた。雇用率はそれぞれ２・３８％から０・７０％、２・４４％から０・８０％になった。制度を所管する厚労省でも不適切な算入があったが、法定雇用率は達成していた。

厚労省が従来公表していた調査では、障害者の雇用者数は計約６９００人で、平均雇用率は２・４９％だった。３３機関のうちで法定雇用率を達成できなかったのは１機関だけとしていた。

国や地方自治体、企業などには従業員の一定割合（法定雇用率）以上の障害者を雇用する義務がある。雇用率に算入できる障害者は厚労省がガイドラインで定めており、原則、身体障害者手帳、知的障害者の療育手帳、精神障害者保健福祉手帳の交付を受けている人などとしている。

２８日の閣議後会見では水増しの理由について、国税庁を所管する麻生太郎財務相は「（算入できる障害者の範囲について）解釈の仕方が違っていたことに端を発している」、石井啓一国交相は「ガイドラインを幅広くとらえて計上した」などと弁明した。

今回の水増しは、５月に財務省から雇用率に算入できる対象範囲について厚労省に問い合わせがあったことをきっかけに疑いが浮上。厚労省が６月２０日に再調査を各機関に指示していた。

今回の問題をうけ、立憲民主党の辻元清美国会対策委員長は２８日午前、自民党の森山裕国対委員長と国会内で会談し、衆院厚労委員会の閉会中審査を求めた。辻元氏は「障害者団体や専門家を参考人として呼び、声を聞くべきだ」と主張。森山氏は実態解明になお時間がかかると慎重だったが、厚労委の開催については与野党の筆頭理事同士で話し合うとした。