L’application Web populaire SynergyFinder pour l’analyse interactive et la visualisation des données de dépistage de combinaisons de médicaments a été largement améliorée. Les nouvelles fonctionnalités prennent en charge en particulier l’analyse de données de combinaison d’ordre supérieur et la visualisation exploratoire des modèles de synergie multi-médicaments.

Depuis sa première version en 2017, SynergyFinder est devenu un outil Web largement utilisé à la fois pour la découverte de nouvelles combinaisons synergiques de médicaments dans des systèmes de modèles précliniques (par exemple, des lignées cellulaires ou des cellules dérivées de patients primaires) et pour une meilleure compréhension des mécanismes d’efficacité ou de résistance du traitement combiné.

Actuellement, la recherche de découvertes combinatoires de médicaments assiste à un changement de paradigme des «deux médicaments combinés» traditionnels vers les «cocktails multi-médicaments» plus complexes. En conséquence, des thérapies combinées d’ordre supérieur impliquant trois médicaments ou plus sont à l’étude pour de multiples maladies.

Pour répondre au besoin de plates-formes analytiques visuelles faciles à utiliser pour les données de combinaison de médicaments d’ordre supérieur, les chercheurs de la FIMM ont publié une nouvelle version de l’application Web SynergyFinder qui permet l’analyse des données de combinaison de médicaments par paire et d’ordre supérieur.

En plus des options d’analyse et de visualisation innovantes et améliorées pour les données de combinaison de plusieurs médicaments, SynergyFinder 2.0 met également en œuvre une procédure de détection des valeurs aberrantes automatisée, une fonctionnalité d’ajustement de courbe étendue, une évaluation statistique des mesures répétées, ainsi que de nombreuses autres améliorations demandées par les utilisateurs de SynergyFinder.

Le document décrivant l’outil Web SynergyFinder 2.0 a été publié dans le NAR Web Server Issue 2020 . SynergyFinder est un logiciel open source disponible gratuitement en tant qu’outil Web . Le logiciel est livré avec des exemples de données de combinaison de médicaments, un didacticiel vidéo et des instructions techniques pour l’utilisateur. Les codes sources de l’implémentation de l’application Web sont disponibles gratuitement dans GitHub .

Source : Helsinki