Im Juli 2012 stiess Balanta vom Nachwuchs von Atletico River Plate ins Kader der 1. Mannschaft, für die er bis heute 82 Mal im Einsatz stand und drei Tore erzielte. Sein Debüt mit der kolumbianischen A-Nationalmannschaft bestritt er im März 2014; für Kolumbien absolvierte er bis anhin sechs Spiele. Der Linksfüsser wurde mit Atlético River Plate argentinischer Meister (2014), gewann die Copa Libertadores (2014/2015), die Copa Sudamericana (2013/2014) sowie die Recopa Sudamericana (2014/2015).



Éder Balanta reiste am Tag der Unterschrift nach Crans-Montana ins Trainingslager der 1. Mannschaft des FCB und trägt die Trikotnummer 23.