AK Parti’nin iktidara geldiği 2002 yılından itibaren de eğitim alanında birçok köklü değişiklik söz konusu oldu. Örneğin 2002 yılında, 28 Şubat döneminden miras katsayı uygulamasında artış oldu. Buna göre imam hatip liseleri mezunları ve meslek lisesi mezunları alanları dışından bir bölüm tercihi yapacaklarında ortaöğrenim başarı puanları 0,3 ile, alanları içinden tercih yapacaklarında ise 0,8 ile çarpılmaya başlandı. Ancak bu katsayı uygulaması 2011 yılında YÖK tarafından kaldırıldı.

Bir başka yenilik ise 2004-2005 eğitim öğretim yılında uygulanan ilköğretim müfredat değişikliği oldu. Bu müfredat değişikliğinin örneklerinden biri eski adıyla Fen Bilgisi, yeni adıyla Fen ve Teknoloji dersinin süresi haftada 4 saate çıkarılması oldu (ERG 2007 İzleme Raporu s.63).

2005 yılında da eğitimde bir dizi değişiklik söz konusuydu. Örneğin liselerde eğitim süresi 4 yıla çıkarılırken, yabancı dilde hazırlık sınıfları da birkaç örnek hariç tarih oldu. Eğitimin 8 yıla çıkarılmasıyla ortaokul sonrası girilen LGS de 2005 yılında kaldırılıp, yerine Ortaöğretim Kurumlarına Giriş Sınavı (OKS) getirildi. Ancak 2008 yılında bu sistem de kaldırıldı, yerine üç aşamalı Seviye Belirleme Sınavı (SBS) getirildi. Fakat bu değişikliğin ömrü de kısa oldu; 2010’da yeniden tek sınav sistemine dönüş yapıldı (ERG 2010 İzleme Raporu s. 26). Bu tek sınav da SBS olarak anılmaktaydı. Ancak Milli Eğitim Bakanlığı 2013 yılında bir kez daha sınav sistemi değişikliğine giderek, Temel Eğitimden Ortaöğretime Geçiş (TEOG) sınavını duyurdu. Böylece 2004 ila 2013 yılları arasında ortaöğretime geçişi sağlayan sınav sistemlerinde tam 5 kez değişiklik yaşandı (ERG 2013 İzleme Raporu s.84). Sınav sistemindeki bir diğer köklü değişiklik ise 2009 yılında oldu, üniversiteye giriş sınavları tek aşamadan iki aşamaya çıkarıldı.

Ayrıca 2010 itibariyle düz lise olarak bilinen genel liselerin ya Anadolu lisesi ya da meslek ve teknik öğretim veren liselere dönüştürülmesi süreci başlatıldı.