2006年にテレビ東京系で放送されたSFアニメ「ゼーガペイン ZEGAPAIN」に、新規カット追加などの再編集を施した劇場版。謎めいた美少女との遭遇を機に、異世界で巨大ロボットを駆る戦いに身を投じる男子高校生たちの姿を追う。監督を務めた下田正美、ボイスキャストの浅沼晋太郎、花澤香菜、川澄綾子、朴路美ら、テレビ版のメンバーが結集する。新解釈に基づいた物語に加えて、新キャラクターの登場にも注目。

あらすじ

廃部寸前の水泳部に所属する男子高校生ソゴル・キョウは、幼なじみのカミナギ・リョーコが制作する自主映画に出演することになる。撮影の最中にプールで見掛けた美少女を入部希望者だと思って声を掛けるキョウだが、彼女はプールに飛び込んでどこかへ消えてしまう。水泳部のPRビデオに出演してもらいたいと捜し回っていると、彼女がまばゆい光とともに出現する。あっけにとられるキョウにミサキ・シズノと名乗った美少女は、彼を半透明の装甲をまとった巨大なロボットのゼーガペイン アルティールに乗せて異世界へと連れていく。