Служба безопасности Украины завела уголовное дело на Анатолия Вассермана по подозрению в сепаратизме. Такое решение принято по запросу депутата Верховной Рады Алексея Гончаренко.

По мнению депутата, деятельность Вассермана, имеющего украинское гражданство, наносит ущерб интересам Украины. Гончаренко обвиняет его в посягательстве на суверенитет и территориальную целостность государства.

В запросе говорится, что Вассерман занял «устойчивую сепаратистскую позицию». По словам депутата, Вассерман призывает к изменению конституционного строя и государственных границ Украины.

Анатолий Вассерман неоднократно высказывался против независимости Украины. Он называл Украину «такой же неотъемлемой частью России, как Сибирь или Кубань», а украинский язык — диалектом русского. Большинство украинцев Вассерман считает русскими.

Смену власти на Украине в результате массовых выступлений в феврале 2014 года Вассерман характеризует как государственный переворот.