2014年11月1日、茨城県つくば市にある「高エネルギー加速器研究機構（KEK）」で、とあるコンピューターの最終テストが行われていた。すでに日の暮れた辺りに人気はないが、建物の中では十数人の男たちが忙しなく動いていた。ある者はひたすらモニターに映し出される細かい数字を追いかけ、ある者は頭を抱えながら机に向かって計算式を書き連ねる。大学の講義室のような雑然とした部屋の机の上には、計測器や工具が散らばり、コーヒーの空き缶が無造作に置かれている。

20人に満たないヴェンチャー企業PEZY Computingが、7カ月間という常識では考えられないほどの短期間で生み出したスーパーコンピューター「Suiren」（睡蓮）。その最初の計算結果を少しでもよいものにしようと、社員たちが連日泊まり込みで働いていた。

この常識破りのスパコンが生まれ、世界へと漕ぎ出そうとする最前線に、PEZY Computing創業者兼最高経営責任者（CEO）、同時に医師でもある現在47歳の齊藤元章はいた。眼鏡にかかる前髪を時折かき上げながら、メンバーのなかでもひときわ鋭い視線で、彼らのスパコンの生命線である冷却システムの温度変化を見つめている。

Suirenが挑んでいるのは、毎年2回ずつ、6月と11月に発表されている、世界で最も高速なコンピューター上位500位のランキング「TOP500」と世界で最もエネルギー消費効率のよいコンピューターランキング「GREEN500」だ。この日、11月1日は、TOP500の申請締切日。齊藤らは申請に必要なデータを得るためのテストに、徹夜続きで臨んでいたのである。

2つのランキングでは、非常に負荷の大きな「HPL」（High Performance Linpack）と呼ばれる計算ソフトを、どれほどの速度で計算できるかで性能が評価される。だが、Suirenによる計算は思うように進まない。テストの最中にはコンピューターの心臓部であるCPUにトラブルが生じ、スパコンを冷却するための冷却液にも異常な温度上昇が検出された。すぐに社員のひとりが外へ走り、少しでも冷却効率を上げようと冷却装置に水をかける。計算は何度もストップし、そのつど、最初からやり直しとなった。

やがて、「パス！」という齊藤の歓喜の声が部屋に響いた。その日6度目の挑戦で、Suirenはようやく計算をやり終えたのだ。結果は178.1TFLOPS（テラフロップス）、1Wあたり4.6GFLOPS（ギガフロップス）。豆電球を灯せるほどの電力で、1秒間に46億回もの計算が行える性能を証明し、彼らは無事、TOP500への申請を終えたのだった。

13日後の11月14日、今度はGREEN500のためのデータ申請最終日に、Suirenは4.95GFLOPS／Wを記録。その結果は2014年のGREEN500で、5.27GFLOPS／Wの成果を叩き出したドイツのGSI Helmholtz Centerのコンピューターに次いで、世界第2位となった。さらに翌2015年6月の同ランキングで、PEZY Computingによる新モデル「Shoubu」（菖蒲）と「Suiren Blue」（青睡蓮）、そして「Suiren」の3台のスパコンは1〜3位を獲得。スパコン開発を始めて約1年しか経ていない、わずか20人程の小さなヴェンチャーは、世界のコンピューターの祭典で表彰台を独占してしまったのである［編注：2016年6月のGREEN500でも、Shoubuが世界第1位を獲得している］。