







Highlights

• Another species of matamata (Chelus orinocensis), one of the most bizarre turtles of the world, is described as new to science.

• Chelus orinocensis differs genetically and morphologically significantly from C. fimbriata.

• The two species diverged in the late Miocene, approximately 13 million years ago.

• Chelus orinocensis occurs in the Orinoco and Río Negro Basins and the Essequibo drainage; C. fimbriata sensu stricto is restricted to the Amazon Basin and the Mahury drainage.

• Chelus orinocensis possess in the Essequibo and Branco Rivers introgressed haplotypes from C. fimbriata.









Abstract

The matamata is one of the most charismatic turtles on earth, widely distributed in northern South America. Debates have occurred over whether or not there should be two subspecies or species recognized due to its geographic variation in morphology. Even though the matamata is universally known, its natural history, conservation status and biogeography are largely unexplored. In this study we examined the phylogeographic differentiation of the matamata based on three mitochondrial DNA fragments (2168 bp of the control region, cytochrome oxidase subunit I, and the cytochrome b gene), one nuclear genomic DNA fragment (1068 bp of the R35 intron) and 1661 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). Our molecular and morphological analyses revealed the existence of two distinct, genetically deeply divergent evolutionary lineages of matamatas that separated in the late Miocene (approximately 12.7 million years ago), corresponding well to the time when the Orinoco Basin was established. As a result of our analyses, we describe the genetically and morphologically highly distinct matamata from the Orinoco and Río Negro Basins and the Essequibo drainage as a species new to science (Chelus orinocensis sp. nov.). Chelus fimbriata sensu stricto is distributed in the Amazon Basin and the Mahury drainage. Additionally, the analyses revealed that each species displays phylogeographic differentiation. For C. orinocensis, there is moderate mitochondrial differentiation between the Orinoco and the Río Negro. For C. fimbriata, there is more pronounced differentiation matching different river systems. One mitochondrial clade was identified from the Amazon, Ucayali, and Mahury Rivers, and another one from the Madeira and Jaci Paraná Rivers. The C. orinocensis in the Essequibo and Branco Rivers have haplotypes that constitute a third clade clustering with C. fimbriata. Phylogenetic analyses of the R35 intron and SNP data link the matamatas from the Essequibo and Branco with the new species, suggesting past gene flow and old mitochondrial introgression. Chelus orinocensis is collected for the pet trade in Colombia and Venezuela. However, neither the extent of the harvest nor its impact are known. Hence, it is crucial to gather more information and to assess its exploitation throughout its distribution range to obtain a better understanding of its conservation status and to design appropriate conservation and management procedures.





Keywords: Amazonas, Chelus orinocensis sp. nov., mtDNA, nDNA, Orinoco, South America, Taxonomy

















photos: Fernando Trujillo.













Chelus orinocensis sp. nov.





Etymology: The species name orinocensis is a Latinized adjective and refers to the Orinoco drainage as core distribution of the new species.





Proposed vernacular names: Orinoco matamata (English), mata-mata do Orinoco (Portuguese), matamata orinocence, matamata del Orinoco, caripatúa (Spanish). The Sikuani indigenous group, native people in the Orinoco region, name this turtle “Atzapani”.

For Chelus fimbriata the following vernacular names are proposed: Amazon matamata (English), mata-mata amazônica (Portuguese), matamata amazonica, matamata del Amazonas (Spanish).





Distribution: Chelus orinocensis occurs in the Orinoco Basin and the upper Río Negro (Amazon Basin) in north-western South America, ....





















photos: Fernando Trujillo.









Chelus spp.) and Clarify Their Phylogeography. Molecular Phylogenetics and Evolution. In Press, 106823. DOI: 10.1016/j.ympev.2020.106823 Mario Vargas-Ramírez, Susana Caballero, Mónica A. Morales-Betancourt, Carlos A. Lasso, Laura Amaya, José Gregorio Martínez, Mariadas Neves Silva Viana, Richard C. Vogt, Izeni Pires Farias, Tomas Hrbek, Patrick D. Campbell and Uwe Fritz. 2020. Genomic Analyses reveal Two Species of the Matamata (Testudines: Chelidae:spp.) and Clarify Their Phylogeography.DOI:

twitter.com/CLassoAlcala/status/1043223205152997376

C.A. Lasso, F. Trujillo, M.A. Morales-Betancourt, L. Amaya, S. Caballero, B. Castañeda Carlos A. Lasso, Fernando Trujillo, Monica A. Morales-Betancourt, Laura Amaya, Susana Caballero and Beiker Castañeda. 2018. Conservación y tráfico de la tortuga matamata, Chelus fimbriata (Schneider, 1783) en Colombia: un ejemplo del trabajo conjunto entre el Sistema Nacional Ambiental ONG y academia [ Conservation and trafficking of the Matamata Turtle, Chelus fimbriata (Schneider, 1783) in Colombia: an example of joint efforts of the National Environmental System, one NGO, and academia ] . Biota Colomb. 19(1); 147-159. DOI: 10.21068/c2018.v19n01a10



Red de tráfico internacional pone en riesgo a extraña especie de tortuga de la Orinoquia sostenibilidad.semana.com/actualidad/articulo/una-red-de-trafico-tiene-en-peligro-a-las-tortugas-matamata-de-la-orinoquia/49867



RESUMEN: La matamata es una de las tortugas más carismáticas del mundo, ampliamente distribuida en el norte de Sudamérica. Debido a su variación morfológica geográfica, se debate sobre el reconocimiento de dos subespecies o especies. A pesar de que la matamata es universalmente conocida, su historia natural, estado de conservación y biogeografía han sido muy poco estudiados. En este estudio examinamos la diferenciación filogeográfica de las matamatas en base ​​a tres fragmentos de ADN mitocondrial (2168 pb de la región de control, la subunidad I del citocromo oxidasa y el gen del citocromo b), un fragmento de ADN genómico nuclear (1068 pb del intrón R35) y 1661 polimorfismos de nucleótido único (SNP). Nuestros análisis moleculares y morfológicos revelaron la existencia de dos linajes evolutivos distintos de matamatas, genéticamente divergentes que se separaron en el Mioceno tardio (hace aproximadamente 12.7 millones de años), correspondiendo al tiempo en que se estableció la cuenca del Orinoco. Como resultado de nuestros análisis, describimos las genéticamente y morfológicamente distintas matamatas de las cuencas del Orinoco, Río Negro y Essequibo como una especie nueva para la ciencia (Chelus orinocensis sp. nov.). Chelus fimbriata sensu stricto se distribuye en la cuenca del Amazonas y en el drenaje del Mahury. Adicionalmente, los análisis revelaron que cada especie muestra diferenciación filogeográfica. Para C. orinocensis, hay una moderada diferenciación mitocondrial entre el Orinoco y el Río Negro. Para C. fimbriata, hay una diferenciación más pronunciada, concordando con los diferentes sistemas fluviales. Se identificó un clado de los ríos Amazonas, Ucayali y Mahury y otro de los ríos Madeira y Jaci Paraná. Las C. orinocensis de los ríos Essequibo y Branco tienen haplotipos que constituyen un tercer clado que se agrupa con C. fimbriata. Los análisis filogenéticos del intrón R35 y los datos de SNP asocian las matamatas de Essequibo y Branco con la nueva especie, sugiriendo flujo de genes pasado ​​e introgresión mitocondrial antigua. Chelus orinocensis se colecta para el comercio de mascotas en Colombia y Venezuela. Sin embargo, ni se conoce el alcance de las colectas ni su impacto. Por lo tanto, es crucial recopilar más información y evaluar su explotación en todo su rango de distribución, comprender mejor su estado de conservación y para diseñar acciones apropiadas de conservación y manejo.



