gitを使っていて、間違ったファイルを git add してしまった場合に、 これをキャンセルする為には、以下のコマンドが使えます。

1 % git rm --cached <filename>

git rm は、Working Tree (作業コピー)と index からファイルを削除するコマンドですが、 --cached を指定する事で、 indexからのみファイルを削除する事ができます。